七圆桌骑士也因力寡难支沦为Zero的帮凶被关押。枢木朱雀从帝国内部进行改革的大计功亏一篑。

就在一切看似结束时，欧洲布列塔尼亚军事统帅夏英格的叛逆被镇压，军师与第七骑士被皇帝的特派洛洛接回了帝国本土。

这件事情后，刘宣和莫妮卡因为镇压叛乱有功，分别被提拔为第十一和第十二圆桌骑士。

随后一年朱雀继续作为皇帝的直属骑士，奔走于世界各地；如接受修奈泽尔的指挥，在波尔多地区大破eu方面的普鲁士、法兰西、尼德兰、威尼斯联合部队。

之后，朱雀再次以学生身份回到了阿什弗德学园，这时朱雀的其中一个任务是确定鲁路修有否恢复记忆。同时兼任娜娜莉总督的总督辅佐官。确认了鲁路修就是复活的Zero后，因为太温柔而且不想变成鲁路修那样的人，朱雀放弃了对被俘的卡莲使用Refrain（一种精神毒品）使其坦白交代一切的想法。

在前往机密情报局再度确认鲁路修是否恢复记忆时，发现情报人员维蕾塔、洛洛皆失踪，询问情报人员却重复回答无可奉告，朱雀才发现情报人员早已被鲁路修给控制了，因而更确信鲁路修已经恢复记忆的事实，然而考虑到行政特区日本还未完成，暂时不举报鲁路修已经恢复记忆这一事实。

在第二次东京决战中，因受到鲁路修活下去的GEASS的影响，激发了朱雀的求生本能，使他亲手发射了战略武器芙蕾雅，造成了两千万以上的人员伤亡。

后来朱雀又以成为第一骑士为条件，协助修乃泽尔发动政变。可惜最后被皇帝及第一骑士俾斯麦发现，因不敌俾斯麦，强行被自己所中的活下去的Geass启动逃走，却因此而遇见c.c.、阿妮亚和玛丽安娜，得以进入思考升降梯系统。

思考升降梯系统中，朱雀被告知c的世界的真相，并且选择了站在鲁路修一边，共同挫败了皇帝查尔斯改变世界的弑神计划，阻止了一成不变的停滞的世界，选择让人类世界持续运转下去，用自己的双手创造人类的幸福。

当然这都是后话。